Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCC1Q96CN9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms