Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYTL4Q96C24 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SYTL4Q96C24 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYTL4Q96C24 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms