Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VOPP1Q96AW1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VOPP1Q96AW1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms