Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCE1Q969G3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms