Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC4Q92889 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERCC4Q92889 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms