Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAD50Q92878 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAD50Q92878 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms