Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT35Q92764 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT35Q92764 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms