Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3AQ92484 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms