Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CTTNBP2Q8WZ74 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTTNBP2Q8WZ74 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms