Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNKSR2Q8WXI2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNKSR2Q8WXI2 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms