Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV28

BLNK, B-cell linker protein, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLNKQ8WV28 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BLNKQ8WV28 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BLNKQ8WV28 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms