Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSKUQ8WUA8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms