Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
RB1CC1Q8TDY2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
RB1CC1Q8TDY2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RB1CC1Q8TDY2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms