Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTLL11Q8NHH1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TTLL11Q8NHH1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms