Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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ZNF548Q8NEK5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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ZNF548Q8NEK5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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ZNF548Q8NEK5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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ZNF548Q8NEK5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF548Q8NEK5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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