Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HJURPQ8NCD3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms