Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM87AQ8NBN3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM87AQ8NBN3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms