Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM229BQ8NBD8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM229BQ8NBD8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms