Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHTF2Q8N3S3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHTF2Q8N3S3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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