Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD35Q8N283 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD35Q8N283 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms