Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMYD4Q8IYR2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMYD4Q8IYR2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms