Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NELFCDQ8IXH7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NELFCDQ8IXH7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms