Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PASD1Q8IV76 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PASD1Q8IV76 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms