Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLNKQ7Z7G1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLNKQ7Z7G1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms