Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q71RC1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q71RC1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q71RC1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q71RC1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q71RC1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q71RC1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q71RC1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q71RC1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q71RC1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q71RC1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q71RC1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q71RC1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q71RC1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q71RC1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q71RC1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q71RC1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q71RC1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q71RC1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q71RC1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q71RC1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q71RC1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms