Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP34Q70CQ2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP34Q70CQ2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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