Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYDE1Q6ZW31 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms