Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TPGS1Q6ZTW0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms