Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00299Q6ZSB3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00299Q6ZSB3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms