Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPOCD1Q6ZMY3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms