Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SCIMPQ6UWF3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCIMPQ6UWF3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms