Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRAIDQ6UW56 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRAIDQ6UW56 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms