Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT2Q6UVM3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms