Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMARCD3Q6STE5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCD3Q6STE5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms