Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD2Q6P5Q4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD2Q6P5Q4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD2Q6P5Q4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD2Q6P5Q4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LMOD2Q6P5Q4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LMOD2Q6P5Q4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms