Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RWDD4Q6NW29 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms