Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC70Q6NSX1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC70Q6NSX1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms