Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO4Q6EEV6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUMO4Q6EEV6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms