Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MALRD1Q5VYJ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MALRD1Q5VYJ5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.9 ms