Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC01545Q5VT33 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC01545Q5VT33 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms