Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPANXN1Q5VSR9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms