Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q5VSD8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q5VSD8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q5VSD8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q5VSD8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms