Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC122Q5T0U0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC122Q5T0U0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms