Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NHSL1Q5SYE7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NHSL1Q5SYE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NHSL1Q5SYE7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms