Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HP1BP3Q5SSJ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HP1BP3Q5SSJ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms