Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIN3Q5JUX0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIN3Q5JUX0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms