Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRB2Q5IJ48 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRB2Q5IJ48 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms