Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCAF6Q58WW2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCAF6Q58WW2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms