Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLL1Q53SF7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COBLL1Q53SF7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COBLL1Q53SF7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms