Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LACTB2Q53H82 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LACTB2Q53H82 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms